Journée ADÉM: "Apprentissage à partir de Données d'Écologie Marine"
Informations générales
Date: 9 Dec. 2024, 10h - 17h
Lieu: Laboratoire CRIStAL, Université de Lille - Campus scientifique, Bâtiment ESPRIT, Avenue Henri Poincaré 59655 Villeneuve d'Ascq
Organisateurs: Maxime Folschette, Sébastien Lefebvre et Cédric Lhoussaine.
Inscription
L’inscription est gratuite mais obligatoire, avant le 1er décembre:
https://framaforms.org/journee-adem-apprentissage-sur-des-donnees-decologie-marine-1729580692
Présentation
L'avènement de l'informatique a permis l'essor de la collecte, du partage et de l'utilisation de grandes quantités de données. Malgré cela, de nombreuses données restent difficiles à exploiter du fait de leur taille, de leur hétérogénéité, de leur complxité… C'est dans ce cadre que les techniques d'apprentissage automatique (du domaine de l'intelligence artificielle) entrent en jeu.
Ce workshop, organisé dans le cadre du projet ARIEP (CNRS MITI), s'intéresse plus particulièrement au cas des données d'écologie marine, pour lesquelles des programmes de prélèvements ont permis une accumulation conséquente de données : biotiques ou abiotiques, de comptage ou RNA-seq, en différents lieux et dans différents milieux, etc. Ces données permettent de rendre compte de l'évolution des populations observées au cours du temps ou dans l'espace, de l'impact de l'Homme et du réchauffement climatique…
Le but de ce workshop est de réunir des chercheuses et des chercheurs qui appliquent des approches d'apprentissage automatique à des données d'écologie marine. Il s'adresse donc notamment aux collègues d'écologie et d'informatique, mais aussi à toutes les autres disciplines qui pourraient être concernées.
- Recherche de motifs temporels ou spatiaux
- Prédiction
- Compréhension des interactions ou des niches écologiques
- Construction automatique de modèles
- équations différentielles
- réseaux de régulation discrets
- réseaux de réactions biochimiques
- modèles conceptuels
- Problématiques d'explicabilité
- Réseaux de neurones
- Approches symboliques
Programme
10:30 Accueil
10:45 Sébastien Lefebvre (Université de Lille) : "Interactions dynamiques dans le plancton marin" (diapos)
11:15 Samuel Chauffron (Université de Nantes, CNRS): "Learning community network models to reveal marine plankton ecology and evolution” (diapos)
11:45 Damien Eveillard (Université de Nantes): "Constraint-based modeling of ocean biogeochemistry"
12:15 Repas (buffet)
13:45 Loïc Paulevé (Université de Bordeaux, CNRS): "Inference of ecological networks and possibilistic dynamics based on Boolean networks from observations and prior knowledge" (diapos)
14:15 Aurélien Lemay : "Inférence de langages réguliers avec des modèles neuronaux explicables"
14:45 Émilie Poisson Caillault (Université Littoral Côte d'Opal): "De la segmentation à la prédiction d'événements environnementaux" (diapos)
15:15 Pause café
15:30 Tony Ribeiro (Université de Nantes) & Maxime Folschette (Centrale Lille): "Searching for Phytoplankton Biotic Interactions in the SRN Dataset with LFIT" (diapos1, diapos2)
16:00 Discussion
17:00 Fin